Un polipéptido es una cadena larga de aminoácidos unidos por enlaces peptídicos, generalmente más allá de 20-50 residuos según las convenciones adoptadas. El límite con el oligopéptido es difuso, y el límite con las proteínas lo es igualmente: en general se habla de proteína cuando el polipéptido adopta una estructura tridimensional estable y funcional, a menudo más allá de 50-100 residuos.
Los polipéptidos cubren un rango funcional inmenso. La insulina (51 aa, dos cadenas unidas por puentes disulfuro) es el ejemplo histórico — la primera hormona peptídica secuenciada por Sanger en 1955, y hoy uno de los fármacos más prescritos del mundo. Los péptidos GLP-1 (30 aa), la GIP (42 aa), el glucagón (29 aa), la PTH (84 aa), la calcitonina (32 aa), la ACTH (39 aa), y los fragmentos activos de muchas hormonas pertenecen todos a esta categoría.
En la investigación peptídica moderna, los análogos con relevancia terapéutica son predominantemente polipéptidos: semaglutida (31 aa), tirzepatida (39 aa), retatrutida (39 aa), liraglutida (31 aa), exenatida (39 aa), teriparatida (34 aa). Este tamaño es necesario para reproducir fielmente las múltiples interacciones entre el péptido y el receptor transmembrana, y para integrar modificaciones estructurales (lipidación, sustituciones de aminoácidos no estándar) que prolongan la semivida plasmática.
La síntesis de polipéptidos largos representa un reto técnico: cada acoplamiento SPPS introduce impurezas, y un péptido de 40 residuos sintetizado con un rendimiento del 99% por acoplamiento cae a una pureza bruta del 67% antes de la purificación. De ahí la importancia crucial de una analítica exhaustiva (HPLC preparativa, LC-MS de alta resolución, pruebas de identidad mediante secuenciación de Edman o fragmentación MS/MS) para garantizar una calidad RUO reproducible.
Los polipéptidos constituyen así el nivel técnico y científico superior de un catálogo de investigación, justificando costes más elevados por la complejidad de fabricación y la sofisticación de las aplicaciones que permiten.