Ein Polypeptid ist eine lange Kette aus Aminosäuren, die durch Peptidbindungen verknüpft sind, je nach gewählter Konvention typischerweise ab 20-50 Resten. Die Grenze zum Oligopeptid ist unscharf, ebenso die zu den Proteinen: Von einem Protein spricht man in der Regel, wenn das Polypeptid eine stabile, funktionelle dreidimensionale Struktur annimmt, oft ab 50-100 Resten.
Polypeptide decken ein enormes Funktionsspektrum ab. Insulin (51 aa, zwei durch Disulfidbrücken verbundene Ketten) ist das historische Beispiel — das erste Peptidhormon, das 1955 von Sanger sequenziert wurde, und heute eines der weltweit am häufigsten verschriebenen Arzneimittel. Die Peptide GLP-1 (30 aa), GIP (42 aa), Glucagon (29 aa), PTH (84 aa), Calcitonin (32 aa), ACTH (39 aa) sowie die aktiven Fragmente vieler Hormone gehören alle zu dieser Kategorie.
In der modernen Peptidforschung sind die therapeutisch relevanten Analoga überwiegend Polypeptide: Semaglutid (31 aa), Tirzepatid (39 aa), Retatrutid (39 aa), Liraglutid (31 aa), Exenatid (39 aa), Teriparatid (34 aa). Diese Größe ist notwendig, um die vielfältigen Wechselwirkungen zwischen Peptid und Transmembranrezeptor originalgetreu nachzubilden und Strukturmodifikationen (Lipidierung, Substitutionen durch nicht standardmäßige Aminosäuren) einzubauen, die die Plasmahalbwertszeit verlängern.
Die Synthese langer Polypeptide ist eine technische Herausforderung: Jede SPPS-Kupplung bringt Verunreinigungen ein, und ein Peptid aus 40 Resten, das mit 99% Ausbeute pro Kupplung synthetisiert wird, fällt vor der Aufreinigung auf 67% Rohreinheit. Daher die entscheidende Bedeutung einer gründlichen Analytik (präparative HPLC, hochauflösende LC-MS, Identitätsprüfung durch Edman-Sequenzierung oder MS/MS-Fragmentierung), um eine reproduzierbare RUO-Qualität zu gewährleisten.
Polypeptide bilden somit die technische und wissenschaftliche Spitze eines Forschungskatalogs, was höhere Kosten durch die Komplexität der Herstellung und die Anspruchsvollheit der ermöglichten Anwendungen rechtfertigt.